Phần 1: Người Bạn Nhỏ Của Rừng Đước
Giữa rừng ngập mặn Cà Mau, chú cá Thòi Lòi Tí Xíu sống trên thân cây Đước Bà già cong vút. Từ khi sinh ra đã mồ côi, Tí Xíu được Đước Bà che chở và dạy cho bài hát thì thầm của gió: 'Rễ chằng đất mặn, lá gọi mưa về'. Mỗi sáng, chú phóng những cú nhảy tít cao như muốn chạm vào mây.
Phần 2: Những Vị Khách Lạ
Một ngày nọ, tiếng máy ầm ĩ xé toang bình yên. Những chiếc xe lạ đem theo người đeo mặt nạ, họ dùng cưa máy xẻ thân Đước Bà. Tí Xíu giật mình khi nghe họ nói: 'Đốn hết chỗ này xây biệt thự nghỉ dưỡng'. Cả khu rừng run rẩy dưới lưỡi cưa sắc lẹm.
Phần 3: Hội Đồng Cây Xanh
Tí Xíu gom bạn bè: Cua Rạm biết đào hầm, Chìa Vôi Vịt chuyên... quắp đồ, và Ốc Len giả vờ thành đá cuội. Chúng lập kế phá máy xúc bằng cách bơm nước bùn vào ống xả. Nhưng chiếc máy vẫn gầm rú như con quái vật không biết mệt.
Phần 4: Bàn Tay Nhỏ Nhoi
Một buổi chiều ngập nắng, Tí Xíu phát hiện bé Mai - con gái ông chủ công trình - đang nhặt vỏ sò. Chú liều mình nhảy thụt vào tờ giấy vẽ của bé. Thế là hai kẻ lạ mặt bắt đầu trò chuyện bằng hình vẽ: Tí Xíu vẽ cây Đước Bà bị đốn hạ, Mai vẽ lại khu vườn xanh với hồ bơi thiên nhiên.
Phần 5: Vũ Điệu Của Rễ
Sáng hôm sau, Mai dẫn bố mẹ đến chỗ cây Đước Bà. Cả gia đình sửng sốt khi thấy rừng cây đang hát - từng chiếc rễ chằng chịt quấn lấy nhau tạo thành tấm lưới vững chãi. Ông chủ công trình chậm rãi xé bản thiết kế cũ: 'Chúng ta sẽ xây khu bảo tồn sinh thái, con nhé!'.
Phần 6: Tiếng Thì Thầm Mới
Giờ đây, du khách đến nghe Tí Xíu kể chuyện bằng những cú nhảy tưng bừng. Cánh rừng thì thầm bài ca mới: 'Lá xanh thêu nắng, rễ ôm biển người'. Và mỗi khi hoàng hôn buông, chiếc đuôi óng ánh của chú cá nhỏ lại vẫy chào những trái tim biết lắng nghe thiên nhiên.