Giữa lòng đại dương xanh thẳm, rạn san hô Ngũ Sắc từng là nơi rực rỡ nhất vùng biển nhiệt đới. Thế nhưng gần đây, những tảng san hô dần nhạt màu, cá con bơi qua đều hắt hơi vì nước biển nóng lên. Rùa Cộc – chú rùa già từng đi khắp đại dương – lo lắng thông báo: "Chúng ta phải tìm Bạch Tuộc Thủy Tinh, vị thần giữ rạn san hô!"
Cá Hề Tia Chớp – bạn nhỏ nhanh nhẹn nhất đàn – lập tức xung phong dẫn đường. Họ tới hang động ngầm và kinh ngạc thấy Bạch Tuộc Thủy Tinh đang yếu ớt, lớp da phủ đầy vệt dầu đen. "Chất độc từ rác thải đã làm tê liệt tảo cộng sinh của ta..." – vị thần thở dài.
Hai bạn nhỏ quyết định đi tìm loại tảo đặc biệt ở ba vùng biển: Rừng Tảo Bẹ Khổng Lồ, Đảo Ngọc Trai Lấp Lánh và Vực Thẳm Phát Sáng. Trên đường đi, họ cùng cá voi lưng gù nhấn chìm túi nilon, nhờ sứa biển làm sạch nước, và giải cứu một chú đồi mồi mắc kẹt trong lưới rác.
Khi mang tảo về, cả rạn san hô bừng tỉnh bằng điệu nhảy kỳ diệu của Bạch Tuộc Thủy Tinh. Bất ngờ nhất là chiếc chai thủy tinh do chính Tia Chớp gửi đã dạt vào bờ, khiến các bạn nhỏ ven biển tổ chức dọn rạn san hô và trồng thêm cây ngập mặn. Từ đó, Ngọn Hải Đăng Xanh – do con người và sinh vật biển cùng vận hành – trở thành biểu tượng của tình bạn xuyên thủy tinh.